Kvantitativní vyšetření buněčného chimerismu po alogenní transplantaci krvetvorných buněk

Od roku 2005 skupina vyšetření buněčného chimerismu Národní referenční laboratoře ÚHKT pravidelně organizuje program Zkoušení způsobilosti pro oblast kvantitativního vyšetření chimerismu po alogenní transplantaci krvetvorných buněk (alHSCT). Tohoto programu se účastní jak laboratoře z České republiky, tak i ze zahraničí.

Každá ze zúčastněných laboratoří má na výběr ze dvou variant – základní a rozšířená. Základní varianta zahrnuje 7 vzorků DNA, rozšířená 12 vzorků DNA označených pořadovým číslem 1P (příjemce), 2D (dárce) a dalších 5 (10) vzorků pro kvantifikaci 3TP – 7TP (12TP).

K testování jsou vybrané vzorky DNA získané, připravované a uchovávané dle pravidel uvedených v Příručce kvality NRL pro DNA diagnostiku a v příslušných přílohách SOP 01, SOP 07.

Problematikou zkoušení způsobilosti je:

1. Vyšetření informativity (určení referenčních alel) na základě vyšetření vzorků DNA příjemce (vzorek 1P) a jeho dárce (vzorek 2D) – 2 vzorky – nepovinná část.
2. Kvantitativní vyšetření chimerismu stejného pacienta v 5 obdobích (rozšířená varianta 10 obdobích) po alHSCT na základě vybraného(ných) DNA polymorfismu(ů), resp. i sex specifických lokusů – 5 vzorků (rozšířená varianta 10 vzorků) včetně interpretace – povinná část.

Účastník provádí vyšetření metodami běžně používanými v jeho laboratoři.

Výsledné hodnoty účastníka budou porovnány s očekávanými hodnotami a statisticky dle Z-skóre.

Hodnocení na kategorie:

• výborné ([z] ≤ 1)
• dobré (1 ˂ [z] ≤ 2)
• akceptovatelné (2 ˂ [z] ≤ 3)
• kritické ([z] > 3)  - nesprávný výsledek
• pod detekční limit laboratoře (Citlivost používané metody účastníka není schopna zachytit minoritní genotyp – příklad: očekávané procento minoritního genotypu je 0,2% a účastník s citlivostí 1% detekuje pouze majoritní genotyp – tento výsledek je považován za správně určený. Ale v případě, že účastník detekuje oba genotypy a kvantifikuje ho, je výsledek hodnocen dle Z-skóre.)

Pro splnění účasti EPT je nutná minimálně 80% úspěšnost (tzn. 8/10 vzorků v rozšířené variantě, 4/5 vzorků v základní variantě).

• Zápis ze schůze Steering Committee 2019
• Závěrečná zpráva za rok 2019