Vyšetření a kvantifikace BCR-ABL, detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
SOP 03: Diagnostické vyšetření genu BCR-ABL metodou multiplex RT-PCR
Laboratoř molekulární diagnostiky a monitoringu CML a Ph+ leukémií
(vedoucí Mgr. Kateřina Machová Poláková, Ph.D., technická vedoucí standardních operačních postupů SOP 03 a SOP 04 Mgr. Karla Zemanová, Ph.D).
- Diagnostické vyšetření transkriptu BCR-ABL
- potvrzuje přítomnost fúzního genu BCR-ABL a určuje typ přestavby (major, minor, mikro, a jiné raritní přestavby)
- vyšetření se provádí ze vzorků periferní krve nebo kostní dřeně
- metoda je založena na reverzně transkriptázové polymerázové řetězové reakci (RT-PCR)
- výchozím materiálem je celková RNA
- Molekulární monitorování hladiny transkriptu BCR-ABL
- kvantitativní stanovení transkriptu BCR-ABL pomocí real-time RT-PCR - varianta major (s kontrolním genem GUS od 1.8.2012)
- vyšetření se provádí v pravidelných intervalech (dle léčebného protokolu) z leukocytů periferní krve
- výchozím materiálem je celková RNA
- potvrzení BCR-ABL negativity se provádí citlivější metodou dvoustupňové (nested) RT-PCR
- kvantitativní stanovení transkriptu BCR-ABL pomocí real-time RT-PCR – varianta minor (s kontrolním genem GUS od 3.9.2012)
- Detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
- mutace v kinázové doméně BCR-ABL jsou významným mechanismem rezistence vůči léčbě inhibitory tyrozinových kináz
- metodou přímého sekvenování jsou zjišťovány jednonukleotidové záměny v úseku cDNA kódujícího proteinový řetězec kinázové domény BCR-ABL
- kromě potvrzení a charakterizace mutace se vyšetřuje i procentuální zastoupení mutovaného klonu ve vzorku
Laboratoř organizuje Mezilaboratorní porovnávání zkoušek pro laboratoře v ČR:
Diagnostické vyšetření fúzního genu BCR-ABL
Kvantitativní stanovení hladiny transkriptů BCR-ABL
Detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
a je jmenována Národní referenční laboratoří pro ČR v rámci mezinárodního projektu EUTOS for CML (ELN – European LeukemiaNet).
SOP 04: Monitorování transkriptu BCR-ABL a detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
Laboratoř molekulární diagnostiky a monitoringu CML a Ph+ leukémií
(vedoucí Mgr. Kateřina Machová Poláková, Ph.D., technická vedoucí standardních operačních postupů SOP 03 a SOP 04 Mgr. Karla Zemanová, Ph.D).
- Diagnostické vyšetření transkriptu BCR-ABL
- potvrzuje přítomnost fúzního genu BCR-ABL a určuje typ přestavby (major, minor, mikro, a jiné raritní přestavby)
- vyšetření se provádí ze vzorků periferní krve nebo kostní dřeně
- metoda je založena na reverzně transkriptázové polymerázové řetězové reakci (RT-PCR)
- výchozím materiálem je celková RNA
- Molekulární monitorování hladiny transkriptu BCR-ABL
- kvantitativní stanovení transkriptu BCR-ABL pomocí real-time RT-PCR - varianta major (s kontrolním genem GUS od 1.8.2012)
- vyšetření se provádí v pravidelných intervalech (dle léčebného protokolu) z leukocytů periferní krve
- výchozím materiálem je celková RNA
- potvrzení BCR-ABL negativity se provádí citlivější metodou dvoustupňové (nested) RT-PCR
- kvantitativní stanovení transkriptu BCR-ABL pomocí real-time RT-PCR – varianta minor (s kontrolním genem GUS od 3.9.2012)
- Detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
- mutace v kinázové doméně BCR-ABL jsou významným mechanismem rezistence vůči léčbě inhibitory tyrozinových kináz
- metodou přímého sekvenování jsou zjišťovány jednonukleotidové záměny v úseku cDNA kódujícího proteinový řetězec kinázové domény BCR-ABL
- kromě potvrzení a charakterizace mutace se vyšetřuje i procentuální zastoupení mutovaného klonu ve vzorku
Laboratoř organizuje Mezilaboratorní porovnávání zkoušek pro laboratoře v ČR:
Diagnostické vyšetření fúzního genu BCR-ABL
Kvantitativní stanovení hladiny transkriptů BCR-ABL
Detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL
a je jmenována Národní referenční laboratoří pro ČR v rámci mezinárodního projektu EUTOS for CML (ELN – European LeukemiaNet).
Technická vedoucí: Mgr. Karla Zemanová, Ph.D.